Phénotype

Le même génotype, deux plantes radicalement différentes. Une poussant en plein soleil, l'autre à l'ombre, l'une arrosée généreusement, l'autre en stress hydrique. C'est la magie — et toute la complexité — du phénotype : ce que la plante *devient* au croisement de ses gènes et de son monde.

Génotype vs phénotype : les deux faces d'une même plante

En génétique, tout commence par une distinction fondamentale. Le génotype, c'est la carte d'identité moléculaire d'un individu : l'ensemble des allèles inscrits dans son ADN, hérités de ses parents, fixes et immuables tout au long de sa vie. Le phénotype, lui, c'est ce que l'on *observe* : la forme des feuilles, la couleur des fleurs, la hauteur de la tige, la densité des trichomes, l'odeur dégagée.

Pour le cannabis comme pour toute plante, ces deux notions sont indissociables mais non superposables. Deux plantes issues de la même mère — donc au génotype quasi identique — peuvent présenter des traits observables radicalement différents selon les conditions dans lesquelles elles ont grandi. C'est précisément là que réside toute la richesse (et parfois la frustration) du phénotype.

L'équation fondamentale : gènes + environnement = phénotype

La formule, simplifiée, ressemble à ceci : Phénotype = Génotype + Environnement + Interactions G×E. Et c'est cette dernière partie — les interactions entre gènes et milieu — qui rend la prédiction si délicate.

Pour les caractères simples (monogéniques), la correspondance est quasi directe. La couleur violette de certaines variétés de cannabis, par exemple, est souvent liée à un gène unique régulant la production d'anthocyanes. Ici, génotype et phénotype se lisent presque comme une traduction.

Mais la plupart des traits sont polygéniques — ils dépendent de multiples gènes agissant en concert. La hauteur de la plante, le ratio entre certains cannabinoïdes, la morphologie des calices : autant de caractères quantitatifs où l'environnement peut faire pencher la balance. Temperature, photopériode, humidité, nutrition minérale, stress biotiques (insectes, champignons) et abiotiques (sécheresse, UV) — chacun de ces facteurs est capable de moduler l'expression génique et, in fine, de sculpter un phénotype différent à partir d'un même patrimoine génétique.

Le phénotype du cannabis : ce que les cultivateurs observent au quotidien

Dans le monde de la culture du chanvre et du cannabis, le terme « phénotype » est omniprésent — parfois raccourci en « phéno » dans le jargon des cultivateurs. Concrètement, il désigne l'ensemble des caractéristiques visibles et mesurables d'un plant donné :

• Morphologie : hauteur, ramification, forme et taille des feuilles (larges et indica-like ou étroites et sativa-like), compacité des fleurs
• Couleur : du vert tendre au bordeaux profond, selon l'expression des pigments
• Trichomes : densité, opacité, longueur des glandes résineuses observables à la loupe
• Arôme : profil terpénique exprimé (limonène, myrcène, linalol…), très dépendant des conditions de culture et de séchage
• Durée de floraison : certains phénos d'une même variété fleurissent 7 jours plus tôt ou plus tard que leurs cousins génétiques

Quand un sélectionneur ouvre un paquet de graines à pollinisation ouverte, il ne sait pas exactement quel phénotype va s'exprimer. C'est pourquoi la pratique du phénotypage — observer, noter, comparer, sélectionner — est au cœur du travail de breeding.

Le phénome : quand on prend du recul sur l'espèce entière

Si le phénotype décrit un individu (ou même un seul caractère à l'échelle cellulaire ou moléculaire), le phénome désigne l'ensemble des phénotypes observables chez tous les individus d'une espèce. Pour *Cannabis sativa L.*, ce phénome est d'une diversité remarquable : de la plante fibreuse et élancée cultivée pour le chanvre industriel à la variété compacte et résineuse sélectionnée pour sa richesse en CBD, la même espèce génère un éventail phénotypique impressionnant.

Cette plasticité phénotypique — la capacité d'un génotype à produire des phénotypes différents selon l'environnement — est d'ailleurs une caractéristique biologique fondamentale de *Cannabis sativa*, ce qui explique en partie pourquoi cette plante s'est si bien adaptée à des latitudes et des contextes agroclimatiques très variés à travers les siècles.

Phénotype et sélection variétale : l'art du tri

Comprendre le phénotype, c'est comprendre comment les variétés évoluent. Les sélectionneurs (breeders) travaillent précisément à l'interface entre génotype et phénotype :

1. Ils croisent deux génotypes parentaux aux phénotypes intéressants 2. Ils observent les phénotypes exprimés dans la descendance (F1, F2…) 3. Ils sélectionnent les individus dont le phénotype correspond à leurs objectifs (arôme, morphologie, profil en cannabinoïdes…) 4. Ils stabilisent progressivement la lignée pour que le phénotype devienne prédictible et reproductible

Un phénotype peut être « dominant » — s'exprimant même lorsqu'un seul allèle correspondant est présent — ou récessif, ne s'affichant qu'en présence de deux copies de l'allèle. Cette logique mendélienne, bien que simplifiée pour les traits complexes, reste la boussole de base de tout travail de sélection.

La nuance importante : même une variété dite « stable » n'élimine jamais totalement la variabilité phénotypique. L'environnement continuera toujours à jouer son rôle de sculpteur silencieux.

En bref

• Le phénotype est l'ensemble des traits observables d'un organisme — il résulte de l'interaction entre le génotype (fixe) et l'environnement (variable).
• Pour les caractères complexes et polygéniques, le génotype ne permet que d'estimer un phénotype moyen : l'environnement peut faire varier considérablement le résultat final.
• Chez le cannabis, la plasticité phénotypique est particulièrement marquée : morphologie, couleur, arômes, durée de floraison — tout peut fluctuer à partir d'un même patrimoine génétique.
• Le travail de sélection variétale consiste précisément à observer, trier et stabiliser des phénotypes désirables, en sachant qu'une part d'imprévisibilité demeure toujours.